Le lac Natron est le principal site de reproduction du Flamant nain, abritant environ 75 % de la population mondiale. Ces oiseaux ont développé une peau spécialisée et des glandes filtrant le sel pour survivre aux eaux caustiques et à pH élevé du lac, qui constituent une barrière naturelle contre les prédateurs. L'abondance d'algues spiruline dans le lac permet non seulement de nourrir ces immenses colonies, mais confère également aux flamants leur plumage rose emblématique.